El voto ponderado deja el gobierno de las universidades en manos del estamento superior, el de los catedráticos y profesores titulares, que en el caso de la Universitat apenas representa el 3,8 % del cuerpo electoral. Cada vez son más las protestas, sobre todo de estudiantes (el 87 % del censo de la UV), que reclaman una democracia real frente a la «epistocracia» o el gobierno de los que saben. En 2016 las elecciones a rector en la Universidad del País Vasco registraron disturbios con tres estudiantes heridos y otro detenido.

El alumnado de la UV suele llamar al voto nulo. Lo hizo en 2006 cuando sus 888 votos nulos y en blanco superaron a los 536 válidos. En 2014, la Assemblea Interuniversitaria promovió el voto al Ralph Wiggum, el niño de Los Simpson que representa al estereotipo del tonto de la clase. Se anularon una de cada cinco papeletas de los estudiantes, de losque apenas votaron el 5 %.