La Conselleria de Justicia ha determinado la estructura y organización de la Nueva Oficina Fiscal en la Comunitat Valenciana y de la unidad de Apoyo al Fiscal Superior. La dirección de la Oficina Fiscal le corresponde al Fiscal Superior de la Comunitat Valenciana, a los fiscales jefes provinciales y de área. El personal de los cuerpos al servicio de la Administración de justicia de las oficinas fiscales dependerá funcionalmente de dichas jefaturas, y orgánicamente del órgano de la Comunitat autónoma competente en materia de medios personales al servicio de la Administración de justicia. Se persigue avanzar hacia un modelo en el que el fiscal tenga mayor protagonismo por su capacidad de investigación.
