En Moto3, Arón Canet (KTM), se la juega junto al italiano Lorenzo dalla Porta (Honda) y aunque ambos estuvieron en la «pomada»durante toda la jornada, al final se vieron retrasados a la duodécima y undécima posición, respectivamente, con el mejor tiempo del día para otro italiano Andrea Migno (KTM), por delante del español Marcos Ramírez (Honda) y el británico John McPhee (Honda).

El español Alex Márquez (Estrella Galicia 0'0 Kalex) demostró encontrarse en un buen momento de forma y, en una jornada en constante progresión, acabó protagonizando el mejor tiempo en la categoría de Moto2, por delante del surafricano Brad Binder (KTM) y el también español Jorge Martín (KTM). Todas las previsiones meteorológicas advierten de un empeoramiento de las condiciones para la jornada del sábado, en la que se podrían producir intensas lluvias, y que incluso en algunos momentos hicieron saltar las alarmas de no pocos teléfonos móviles con advertencias de la llegada de un nuevo tifón a la zona del trazado, aunque esa posibilidad quedó descartada poco después. Un fallo o algún tipo de virus informático desató la alarma de tifón en Motegi, que luego quedó reducida, como está previsto desde hace días, a la llegada de intensas lluvias tanto en la noche del viernes al sábado como durante prácticamente toda la segunda jornada de entrenamientos en Motegi. Y eso, la llegada de intensas lluvias, fue el principal motivo para que todos los pilotos de las distintas categorías se intentasen esmerar al máximo para conseguir un buen tiempo, ante el temor de no poder mejorar sus registros el segundo día con el asfalto completamente mojado.