Cofrentes es la central nuclear española que más residuos genera de baja, media y alta actividad. La planta valenciana ha generado desde que arrancó en 1985 un total de 7.674 metros cúbicos de residuos de baja y media actividad frente a los 5.415 metros cúbicos producidos por Almaraz, 5.281 de Garoña, 4.799 de Ascó y 3.597 de Vandellós. Además, Cofrentes ha originado 1.775 metros cúbicos de residuos de muy baja actividad y ha gastado 851 toneladas de uranio (que son altamente radioactivos). En España, los materiales radiactivos se clasifican en residuos de muy baja actividad, de baja y media actividad (ambos son almacenados en el centro de El Cabril, Córdoba), especiales y de alta actividad. El combustible gastado de Cofrentes se guarda en dos piscinas y un Almacén Temporal Individualizado.